Theo khung thời gian từ BTC SEA Games 31, môn bóng đá nữ sẽ tiến hành bốc thăm chia bảng vào lúc 10h35. Sau đó, điều được người hâm mộ quan tâm hơn cả chính là môn bóng đá nam sẽ tiến hành bốc thăm lúc 10h50. Địa điểm bốc thăm sẽ được diễn ra tại một khách sạn ở thủ đô Hà Nội.
Trước đó, BTC cũng tiến hành chia nhóm hạt giống, ở môn bóng đá nam U23 Việt Nam và U23 Thái Lan được xếp hạng hạt giống số một. Nhóm 2 gồm Indonesia và Malaysia. Nhóm 3 có Myanmar và Campuchia. Nhóm 4 gồm Philippines và Singapore, nhóm 5 có Lào và Timor Leste. Như vậy, chắc chắn U23 Việt Nam sẽ không nằm chung bảng đấu với U23 Thái Lan ở SEA Games 31.
Vòng bảng môn bóng đá nam sẽ khởi tranh từ ngày 6-16/5. Trong đó, bảng A của U23 Việt Nam sẽ thi đấu vào ngày 6, 8, 10, 13 và 15/5 trên sân Việt Trì (Phú Thọ) và bảng B của Thái Lan sẽ khởi tranh vào ngày 7, 9, 11, 14, 16/5 trên sân Thiên Trường (Nam Định).
Các trận bán kết 1 sẽ diễn ra ở sân Việt Trì (Phú Thọ), trận bán kết còn lại đá ở sân Thiên Trường (Nam Định) đều trong ngày 19/5. Trận chung kết và tranh hạng 3 sẽ diễn ra ngày 22/5 trên sân Mỹ Đình. Các trận sẽ thi đấu theo khung giờ 16h (trận 1) và 19h (trận 2).
Tính đến hiện tại, các đội U23 bao gồm Việt Nam đã hoàn thành đăng ký sơ bộ 50 cầu thủ. Trước khi môn bóng đá nam SEA Games 2021 diễn ra, các đội sẽ phải rút gọn danh sách xuống còn 20 cầu thủ, tương tự như các kỳ SEA Games trước đó.
Tuy nhiên, do ảnh hưởng của dịch Covid-19 cộng thêm đề xuất từ các đoàn thành viên trong khu vực tham dự, môn bóng đá nam sẽ cho phép việc thay thế cầu thủ trong giai đoạn diễn ra SEA Games 2021. Điều này giống với cách làm ở VCK U23 Đông Nam Á 2022 tại Campuchia hồi tháng 2. Khi đó, U23 Việt Nam đã được thay thế 10 cầu thủ do đội hình chính dương tính hàng loạt với Covid-19 qua các trận đấu.
Theo dự kiến từ BTC, số lượt cầu thủ thay thế ở SEA Games 2021 đang được đề xuất lên tới 15 cầu thủ. Trong đó, những cầu thủ trên 23 tuổi có dương tính với Covid-19 sẽ được phép thay thế gương mặt trên 23 tuổi tương ứng.
Điều kiện đủ là gương mặt thay thế này phải nằm trong danh sách sơ bộ 50 cầu thủ đã đăng ký hiện tại. Những cầu thủ U23 được đăng ký sơ bộ sẽ là lựa chọn tương ứng thay thế.
Hiện tại, đội tuyển U23 Việt Nam đã trở về nước sau giải giao hữu quốc tế Dubai Cup 2022 tại UAE. Mặc dù kết quả không được như mong đợi nhưng đây vẫn được xem là trải nghiệm quý giá cho các cầu thủ trẻ nhằm hướng tới SEA Games 31 (tháng 5) và VCK U23 châu Á tại Uzbekistan (tháng 6).
Dự kiến, ĐT U23 Việt Nam sẽ hội quân trở lại vào ngày 7/4 do HLV Park Hang-seo trực tiếp nắm quyền dẫn dắt. Hiện tại, nhà cầm quân người Hàn Quốc cũng đang cân nhắc, tính toán để có sự lựa chọn nhân sự tối ưu nhất cho đội hình của ĐT U23 Việt Nam.